En la Península de Yucatán no hay corrientes superficiales de agua debido a que el suelo está compuesto en su mayor parte por roca altamente permeable, lo que permite que gran parte del agua de lluvia se filtre al subsuelo a través del sistema de fallas, fracturas, cavidades y cuevas que algunas veces pierden su techo, generando la formación de cenotes.

A través de éste sistema subterráneo que recorre el estado desde la mitad de la península, las aguas encuentran las costas, y es posible que exista agua dulce en el mar abierto. El manto acuífero es poco conocido , pero sabemos que existe una capa de agua dulce a través de la península y más abajo, existe una capa de agua salada y más lejos de la costa, la capa de agua dulce es más grande que la de agua salada (Meacham, 2006). De cualquier manera, el volumen de agua dulce y salada y su descarga depende de muchos factores, en primera instancia, podemos decir que más lluvia le da más agua dulce a los depósitos, debido al efecto de la baja presión atmosférica y la tormenta que acompaña la precipitación; el nivel de agua salada sube causando una afluencia grande en el manto, que bloquea la salida del agua dulce hasta que las condiciones climáticas vuelven a la normalidad, y es en ese momento que los depósitos de agua son claramente visibles gracias a la cantidad de agua que se está liberando (Beddows, 2004).